手足口病(HFMD)是夏秋季婴幼儿和儿童的主要急性传染病之一，该病以口腔黏膜疹、皮肤溃疡和手、足部的疱疹为主要特征，具有播散快、流行性强的特点，并可在短时间内造成规模流行。自1958年Robinson报道首例HFMD以来，柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)和肠道病毒71型(EV71)先后成为HFMD流行的主要病原，两种病毒基因型相似并且表现类似的临床症状。其中EV71可引起严重中枢神经系统并发症，如脑膜炎、脑炎、急性迟缓性瘫痪等，甚至危及生命，因而具有更大的危害性。2008年3月安徽省阜阳市发生多名儿童EV71感染致死事件，相继全国多个城市出现HFMD爆发，引起了各级卫生部门的高度重视。卫生部于2008年5月2日将HFMD纳入丙类法定传染病管理，并公布了相应的诊疗、防控指南。为了解湖州市2008－2009年手足口病流行的病因，我们采用荧光定量PCR法进行不同标本病原学检测分析，现将结果报告如下。